峨边地处四川盆地与云贵高原的过渡地带，属亚热带湿润季风气候，春迟，夏短，秋绵雨，冬长，四季分明，垂直差异明显，形成“一山分四季，十里不同天，山顶戴雪帽，山脚百花鲜”的气象景观。境内崇山峻岭，沟壑纵横，高差悬殊，最高马鞍山主峰海拔4288米，最低五渡大沙坝海拔469米。原始森林林海茫茫，山水交错，有大小溪河42条，水产资源极为丰富，野生鱼类10多个品种，娃娃鱼(大鲵)为国家二级保护动物。林海中生长着成片的三月竹、八月竹和箭竹，为野生动物提供了生存繁殖的良好条件，珍稀动物种类繁多，以国宝大熊猫最为珍贵，还有四川山鹧鸪、短尾猴、红腹锦鸡、白腹锦鸡、羚牛、黑熊等。峨边春笋为享誉中外的山珍，名贵中药材有天麻、杜仲、黄连、黄柏等。

幅员辽阔，山高坡陡，物产丰富是峨边的显著特点。境内以坡地居多，坡度在20度以上占48.2％，旱地为耕地的91％，土壤为中性、微酸性和微碱性，壤土占75％。农耕地有机质含量丰富、土层厚且肥沃，盛产茶叶、核桃、花椒、藤椒、花白芸豆，素有大堡莴笋青、宜坪萝卜、雪山豌豆、杨村贡米(红花香米)、勒乌洋芋、万坪、杨河竹笋之称。

2022年，全县城区年平均气温18.0℃，比上年增长0.4个百分点；年极端最高气温40.0℃。降雨量604.2毫米，比上年减少35.4毫米；年一日最大降水量49.6毫米。